细胞命运由细胞内分子调控网络和细胞外微环境共同决定。单细胞组学技术可以测量细胞内的分子表达谱,但损失了空间位置信息。近年来,空间组学技术(Spatial Omics)的快速发展,使得实验人员可以在测量丰富的分子表达谱之外,额外获得空间位置信息,为解析组织微环境提供了条件。本报告将介绍本团队在空间组学领域中的计算方法学研究。
原致远,复旦大学副研究员,博士生导师。周传奖,主持国自然面/青及上海市多项科研项目。武汉大学计算机学院本科,清华大学自动化系博士。长期从事单细胞/空间组学相关机器/深度学习方法研究与应用。成果以第一/通讯作者发表在Nature Methods(2021/2023/2024)、Nature Communications(2022/2024/2025)、Nature Protocols(2024)、Cell Genomics(2024)等期刊。第一作者身份获得中国生物信息学十大进展(2021/2023)、世界人工智能大会青年优秀论文奖。